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“做miRNA下调,QPCR检测miRNA,表达水平无变化”,这到底是怎么回事?现有miRNA抑制手段,无论是基于载体构建的、还是化学合成的,本质上都是用跟成熟体互补的反义miRNA(miRNA海绵体属于不完全互补的反义RNA重复),其可以通过结合miRNA,阻断其与靶基因结合,但并不能有效引发miRNA的降解,原因有两方面:其一是反义RNA与miRNA结合后,序列很短,导致Dicer酶(细胞内降解双链RNA的主角)不能有效结合;其二是miRNA与Ago2以RISC复合物的形式存在,该复合物也会导致Dicer酶无法高效结合。因此,如果以反义RNA技术抑制miRNA功能,QPCR可以做,如果检测出表达水平下降还好,即便未检测到,也不表示抑制无效,正确的做法是直接检测目的基因蛋白水平是否有上调。但若实验者不清楚靶基因的情况下,不检测到miRNA下调,心里是没底的。
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“做miRNA下调,QPCR检测miRNA,表达水平无变化”如何解决呢?反义核酸是在转录后水平发挥功能,要阻断miRNA的产生,理想情况是在生成成熟的miRNA之前阻断。此要求目前唯有CRISPR / Cas9能实现,Cas9通过在pre-miRNA序列中引入突变,从而破坏miRNA表达,是miRNA基因功能缺失研究的一种新方法。福建肖老师运用Cas9技术,针对miR-21基因设计sgRNA ,通过慢病毒递送细胞,并在RNA水平检测到mir-21的下调表达,从而研究出miR-21耗竭对CNE2鼻咽(NPC)细胞生物学特性及其潜在机制的影响。使用Cas9敲除miR-21之后,功能上也呈现出阳性,此外,温医大医院的张老师使用Cas9敲除mir-545,研究了人环状RNA PRKCI(circPRKCI)通过抑制miR-545显示致性,促进人类神经胶质瘤细胞的病理进展3。所以,CRISPR / Cas9对于miRNA的KO是有效的、被认可的、且以QPCR检测表达量完全没有问题。瑞普信生物技术有限公司靠谱第三方检测细胞转染实验!成都ELISA法第三方检测公司推荐
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