ImpaRATOR 是一种 O-聚糖依赖性蛋白酶,可催化糖蛋白和糖肽中与糖基化丝氨酸或苏氨酸残基相邻的肽键的水解。它切割用粘蛋白型O-聚糖修饰的丝氨酸或苏氨酸残基的N-末端,包括唾液酸化物种。粘蛋白型O-聚糖是ImpaRAT活性所必需的,该酶不会消化未修饰的丝氨酸或苏氨酸残基,也不会在糖蛋白的N-糖基化位点。该酶接受 O-聚糖结构,包括唾液酸化he心 1 和he心 2 结构以及 Tn 抗原。Genovis的ImpaRATOR 来源于铜绿假单胞菌,在大肠杆菌中表达。该酶含有 His 标签,分子量为 97 kDa。从而实现 O-糖谱分析、位点占用测定和 O-糖肽图谱以及使用 LC-MS 分析的中级方法。云南N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究
我们展示了使用两种蛋白作为底物的OmniGLYZOR的性能。依那西普是一种 Fc 融合蛋白,含有 TNFα 受体的胞外结构域。该结构域用 2 个 N-糖和 8-11 个 1 个具有不同程度唾液酸化的 O-聚糖修饰。在 37°C 下将这种重糖基化蛋白在 OmniGLYZOR Microspin 柱上孵育 1 小时,可完全去除所有 N-和 O-糖,如中级 LC-MS 分析所示。促红xibao生成素 (EPO) 是一种携带 3 个 N-聚糖和 1 个he心 1 个 O-聚糖的小蛋白质,其总质量的近 40% 由聚糖组成。O-连接聚糖通常存在于蛋白质的暴露位置,因为它们在蛋白质折叠发生后附着。只有负责其合成的糖基转移酶才能接触到这些暴露的位点。河南N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究PNGase F 以冻干粉的形式提供,装在 1000 或 5 x 1000 单位小瓶中,分别用于消化 1 mg 或 5 x 1 mg 糖蛋白。
Fc N-聚糖在抗体的效应功能中起着至关重要的作用,但可能会增加蛋白质表征测定的复杂性。在天然条件下用PNGase F去除Fc N-糖可以表征游离N-糖以及去糖基化抗体的功能和结构。 为了证明PNGase F固定化和PNGase F冻干在天然反应条件下有效去除Fc N-聚糖,对zhiliao性抗体曲妥珠单抗进行了处理。图2中的质量数偏移表明,在37°C下用Genovis的PNGase F冻干或PNGase F固定化孵育1小时后,曲妥珠单抗上的Fc N-聚糖成功去除,与在溶液中用PNGase F冻干处理的样品相比,没有酶干扰用PNGase F固定处理的样品的分析。
genovis的FucosEXO在生理缓冲液和中性pH值中具有活性,使其与大多数样品相容。此外,FucosEXO活性不依赖于任何可能影响LC-MS分析的辅因子,如BSA。根据底物的性质,FucosEXO 可在 1 至 2 小时内水解糖蛋白上的末端 α1-2,3,4 连接的岩藻糖残基,而对于非常复杂的样品可能需要更长的孵育时间。FucoseEXO也可固定在离心柱中,可快速方便地处理高达0.5mg的糖蛋白。使用离心柱形式,将糖蛋白样品与固定化的FucosEXO树脂一起孵育,然后在离心步骤中轻松收集消化的糖蛋白。用于糖蛋白上β1-3,4-连接半乳糖的水解,而不会用酶污染z终制剂。
Genovis的GlycOCATCH®是一种亲和树脂,可特异性结合O-糖基化(粘蛋白型)蛋白和肽,从而实现简单的工作流程,以富集和纯化携带O-聚糖的蛋白质和肽。洗涤离心柱,并用8M尿素洗脱结合的蛋白质。对洗脱材料的分析表明,由于洗脱O-糖基化蛋白,并且树脂与非糖基化蛋白和N-糖基化蛋白的结合可以忽略不计。选择性结合 O-糖蛋白:为了测试选择性,将一系列 O-糖基化、N-糖基化和非糖基化蛋白与Genovis的GlycOCATCH 一起孵育。为了在肽水平上研究Genvois的GlycOCATCH的O-糖特异性,将O-glcyosyled肽(糖蛋白)与一系列未修饰的肽混合。为了测试选择性,将一系列 O-糖基化、N-糖基化和非糖基化蛋白与 GlycOCATCH 一起孵育:洗脱O-糖基化蛋白。云南N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究
OmniGLYZOR 含有固定化酶的混合物可快速有效地去除抗体、融合蛋白;云南N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究
genovis分析依那西普和曲妥珠单抗游离聚糖:为了确认依那西普和曲妥珠单抗中半乳糖损失的LC-MS数据,进行了释放的N-聚糖分析。标记的N-聚糖的分离清楚地表明了依那西普和曲妥珠单抗上半乳糖的丢失,如半乳糖基化聚糖物种的信号丢失所示。该酶是一种有价值的工具,可降低样品异质性,用于分析携带α连接的 GalNAc 残基作为未成熟截短he心 1 的复杂 O-糖蛋白。1. 高效 α-N-乙酰半乳糖胺酶 – 快速、完全去除 Tn-抗原和 α1-3-连接的 GalNAc;2. 实现完全糖基去除,以改善蛋白质表征;3. 可固定在即用型离心柱中。云南N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究
Genvis测试去除唾液酸以揭示电荷变体:唾液酸是带负电荷的糖残基,存在于 N- 和 O-连接的聚糖...
【详情】genvois的OpeRATOR 是一种内切蛋白酶,可催化直接靠近 O-聚糖的天然粘蛋白型 O-糖基...
【详情】OglyZOR 来源于口腔链球菌,在大肠杆菌中表达。该酶含有 His 标签,分子量为 227 kDa...
【详情】与PNGase F类似,Genvois的OmniGLYZOR用于携带N-和简单O-糖的糖蛋白的去糖基...
【详情】经过多年的经验积累及市场积淀,倍笃生物已组合多条不同产品线,分别满足体外诊断、organoid及干细...
【详情】上海倍笃生物科技有限公司(简称“倍笃生物”),由中国科学院及生物医药产业界人士,于2018年1月共同...
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【详情】在抗体药物及核酸药物领域,倍笃生物产品线涵盖药物研发的全流程,主要用——RNA转染试剂、生物活性物质...
【详情】GlycOCATCH设计用于特异性结合粘蛋白型O-糖基化蛋白和肽。亲和树脂基于无活性的Genovis...
【详情】Fc N-聚糖在抗体的效应功能中起着至关重要的作用,但可能会增加蛋白质表征测定的复杂性。在天然条件下...
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