企业商机
单细胞多组学基本参数
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  • 科研(临床)检测服务
单细胞多组学企业商机

单细胞多组学测序技术的发展依赖于各种单一组学检测技术的完善,但即使在单细胞测序技术迅速发展的情况下,在单细胞水平协同检测多个不同的分子层面仍然非常具有挑战性.每一种组学都有不同的特性和测量方法,这些方法在敏感性、特异性、通量和适用性上都有所不同.因此,在单细胞水平对多种组学方法进行整合和应用时,需要在策略上做出改进,以保证各组学间的上游建库以及下游生物信息分析均能良好地兼容,同时也要明确技术的局限性及其对研究结果的潜在影响。随着组学新技术的不断涌现,高通量的方向发展,通过对多组学数据的整合分析,已成为科研究新方向。烈冰单细胞多组学测序服务

reads数、基因表达量及细胞数量判定过程中:以捕获5000个细胞、100G的测序量为标准,每个细胞的reads数大约在50k左右;每个细胞的基因中位数取决于样本的细胞类型,例如成熟的B,T,粒细胞数量较多的组织中,由于该类型细胞表达的基因数普遍较少,导致基因中位数下降。而某一疾病组织、或者体外培养的如干细胞等,他们的基因表达数较高,甚至可以超过1万,这就导致该类样本基因中位数非常高。因此,我们对细胞数量以及基因中位数确认时,需要考察实际组织的细胞组成。成都烈冰单细胞多组学数据分析可视化在单细胞组学技术的支持下,早期妊娠母胎界面的异质性问题得到了更深入的阐述与理解。

其实,空间转录组的概念早就已经存在了,目前已经发表的空间转录组技术有Slide-seq,LCM-seq,seqFISH,MERFISH,Liversinglecellzonation,Geo-seqandTomo-seq。但是这些方法存在操作复杂、检测精度不准确、基因和细胞检测量的限制等问题。10xGenomics公司升级spatialTranscriptomic后推出的Visium空间基因表达解决方案是一款商业化的高精度、高通量空间转录组测序方案。烈冰科技自2020年起,国内率先搭建空间转录组测序服务平台,联合上线单细胞核转录组测序、AbSeq、单细胞TCR-Seq、单细胞ATAC-Seq(ARCHR测序)、空间转录组测序产品结合scRNA-Seq服务,多组学联合助力科研人员探索时空等多维度、多角度的动态变化的生物学信息。烈冰生物为您提供贴心的单细胞研究完整解决方案!

2016年发表的DR-seq和G&T-seq技术,实现在单细胞内同时进行基因组和转录组的测序分析,使得研究人员能够在分析细胞间基因组差异和基因表达异质性的同时,进一步理解基因组序列差异、拷贝数变异与转录组异质性之间的关系.随后在同一个单细胞内,基于转录组、染色质可及性、染色质构象、DNA拷贝数、DNA甲基化、蛋白质丰度或者空间状态等整合分析的多组学方法也相继出现。相较于利用不同的单细胞单组学测序方法从一类细胞中分别获取转录组、基因组、表观遗传组等进行分析,单细胞多组学测序技术可以从同一个单细胞中同时获取多种组学数据,可以更好地反映细胞在特定状态下各组学间的关联以及复杂的分子调控网络。单细胞多组学数据整合的一大挑战在于不同组学的特征空间存在差异。

烈冰科技自主研发的单细胞云平台致力于帮助每一位客户定制化分析数据,深入解读数据分析结果,深入挖掘其背后的生物学意义;从操作便捷、结果可视化、分析可追溯、系统稳定等方面助力单细胞研究,加速科研进程!此外,烈冰生信团队根据丰富的实战经验为用户量身打造了一款单细胞测序结果解读的神兵利器——单细胞浏览器(SingleCellBrowser),不仅可以将海量复杂的结果文件可视化,还可以实现分析结果的三维立体化的展示呈现。专业的生信代码交给专业的烈冰,专业的生物学意义交给专业的您!单细胞多组学测序技术是在单细胞分辨率下精确分析细胞异质性和基因调控网络的新技术。BD Rhapsody单细胞多组学商业化服务

功能研究型单细胞多组学测序技术结合了CRISPR基因编辑技术, 深度挖掘基因表达调控与细胞功能。烈冰单细胞多组学测序服务

如在现有研究方法基础上,进行特定亚细胞区域的蛋白质组学、相互作用蛋白质组学以及某种特定翻译后修饰类型的蛋白质组学的研究等。这将有助于诸多生化过程以及致病机理的全新认识与发现。随着基于单细胞蛋白质组学质谱研究方法的不断发展,单细胞分析方法的灵敏度、蛋白质的覆盖度、细胞通量、空间分辨率以及多组学的兼容能力会不断突破我们的认知极限。更重要的是,单细胞分析在临床诊断、疾病分型以及细胞发展机制这些重大生命科学领域方面的应用将会越来越大。烈冰单细胞多组学测序服务

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