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单细胞多组学基本参数
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  • 科研(临床)检测服务
单细胞多组学企业商机

相对于Smart-Seq技术在细胞数量上的问题,10X平台普遍提供的细胞数量都在1000-20000不等的测序细胞量,这个量级的测序细胞量已经可以说能够完全覆盖绝大部分组织的Single Cell群体类型。因此,这两种技术对于基于基因表达进行准确细胞分型上,无论是从细胞数量上来说还是表达检测可靠性来说,都会更实用。同时依托Random Cell Label技术,使得其对于NovaSeq、HiSeq X Ten、Hiseq 4000等设备存在的Index hooping现象,相对于Smart-Seq数据来说,影响几乎可以忽略不计(10X Genomics官方网站曾给出hooping测试结果,显示无影响。,从多组学的角度对单细胞进行综合分析 将是未来单细胞技术的必由之路。无锡BD单细胞多组学多组学测序

冰冻切片的空间转录组测序在RNA捕获、文库构建方面,需要将组织切片贴合在带有mRNA结合捕获探针的载玻片上,通过甲醛固定、H&E染色得到组织切片的形态结构。再进行透化处理,使细胞中的mRNA释放,并结合到芯片相邻的捕获探针上。将捕获的mRNA反转录合成cDNA并构建测序文库进行上机测序,从而获取基因表达信息。总体来说,空间转录组的实验流程包括:组织冻存-OCT包埋-冷冻切片-固定染色-组织透化-cDNA合成及建库-上机测序,而需要客户进行样本准备的步骤相对简单:组织冻存与OCT包埋。BD单细胞多组学测序服务首先 出现的单细胞多组学方法就是将转录组与其他组学技术结合。

烈冰生信团队倾情研发的NovelBrain®生信大数据分析平台,针对庞大的单细胞测序数据,能够实现细胞类型鉴定的快、精、准:一键导入genelist构建个性化基因列表;轻松一点即可展示Marker基因的Featureplot;任意修改Cluster的颜色和名称助力高效鉴定细胞类型;一键获得t-SNE图、Heatmap和Violin图:轻松获得并下载基因表达的t-SNE图、Heatmap、Violin图,还可以通过调节宽、高和系数比例来调节美观。平台上线300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板,帮助烈冰生信分析团队和自主分析用户实现分析工具和模板的快速调用和一站式全流程自动化分析,节省您的工作时间并提升整体工作效率。

RNA测序(RNA-seq)是转录组学研究的重要工具,也是生命科学领域常用的技术之一。相比于传统通路研究低维度、低通量的局限性,转录组学有以下优势:1)能够动态考察细胞基因组的表达,多维度地反映差异变化;2)可用于研究占RNA绝大部分的非编码RNA,研究其结构以及在细胞生命活动中的重要调控作用;3)与蛋白组学研究相互补充,多角度呈现细胞水平的变化信息。作为转录组学研究的技术基础,RNA测序技术也在不断地更新迭代,现如今更大通量、更深精度的测序为众多科研和医学工作者提供了丰富的工具和探索真理的手段。单细胞多组学测序技术整合了单细胞各个组学特征, 提供了揭示细胞内复杂分子调控网络及其互动关系的机会。

单细胞多组学测序技术的发展依赖于各种单一组学检测技术的完善,但即使在单细胞测序技术迅速发展的情况下,在单细胞水平协同检测多个不同的分子层面仍然非常具有挑战性.每一种组学都有不同的特性和测量方法,这些方法在敏感性、特异性、通量和适用性上都有所不同.因此,在单细胞水平对多种组学方法进行整合和应用时,需要在策略上做出改进,以保证各组学间的上游建库以及下游生物信息分析均能良好地兼容,同时也要明确技术的局限性及其对研究结果的潜在影响。单细胞多学可包括基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、影像组学。广州BD单细胞多组学测序价格

单细胞多组学技术基于单细胞测序技术和高通量组学方法发展而来,能在单细胞分辨率下同时整合多种组学信息。无锡BD单细胞多组学多组学测序

BD的技术不再采用利用微流控孔道射出细胞和射出的磁珠碰撞的过程,进行单细胞捕获的技术,转而采用CytoSeq特有的蜂窝板技术。该技术用20万+的微孔(该数量级远大于Input细胞数量),保证单孔中的单细胞捕获。同时避免了10X中存在的概率碰撞影响捕获效率的问题,采用微孔捕获相对会有更好的捕获效率(来自两家企业商业宣传资料比对),保证Input细胞的高效使用。对于Input细胞的量更少的情况,可以基于百万级别的细胞总量开始进行前期处理以及后期捕获操作。而在细胞捕获完成后,进行细胞裂解后,同样的也进行细胞中RNApolyA序列的抓取工作。无锡BD单细胞多组学多组学测序

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