西安烈冰生物单细胞多组学服务机构

相对于Smart-Seq技术在细胞数量上的问题，10X平台普遍提供的细胞数量都在1000-20000不等的测序细胞量，这个量级的测序细胞量已经可以说能够完全覆盖绝大部分组织的Single Cell群体类型。因此，这两种技术对于基于基因表达进行准确细胞分型上，无论是从细胞数量上来说还是表达检测可靠性来说，都会更实用。同时依托Random Cell Label技术，使得其对于NovaSeq、HiSeq X Ten、Hiseq 4000等设备存在的Index hooping现象，相对于Smart-Seq数据来说，影响几乎可以忽略不计（10X Genomics官方网站曾给出hooping测试结果，显示无影响。功能研究型单细胞多组学测序技术结合了CRISPR基因编辑技术, 深度挖掘基因表达调控与细胞功能。西安烈冰生物单细胞多组学服务机构

相对于Smart-Seq技术在细胞数量上的问题，BD和10X这两个平台普遍提供的细胞数量都在1-6K不等的测序细胞量，这个量级的测序细胞量已经可以说能够完全覆盖绝大部分组织的SingleCell群体类型。因此，这两种技术对于基于基因表达进行准确细胞分型上，无论是从细胞数量上来说还是表达检测可靠性来说，都会更实用。同时依托RandomCellLabel技术，使得其对于NovaSeq、HiSeqXTen、Hiseq4000等设备存在的Indexhooping现象，相对于Smart-Seq数据来说，影响几乎可以忽略不计（10XGenomics官方网站曾给出hooping测试结果，显示无影响。合肥BD Rhapsody单细胞多组学商业化服务目前已应用的单细胞多组学联合分析包括转录组和基因组，转录组和ＤＮＡ甲基化、转录组和蛋白组。

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针对单细胞测序的细胞数量判断环节：主要是对细胞数量、基因表达量、测序质量进行整体描述。过滤标准：由于细胞破碎后游离RNA会释放到环境或孔中，并且测序中也会存在一些死细胞，导致数据存在background值。因此，我们需要设定一定的标准来过滤掉假细胞或死细胞。以10×Genomics为例，细胞数量判断主要通过分析UMICounts-Barcode曲线斜率拐点，当存在多个斜率拐点的时候，结合预期UMI=500时的细胞数量进行过滤。当斜率拐点低于UMI=500的时候，选择UMI=500作为细胞的判断的标准；否则，选择和预期细胞数量非常接近的拐点作为细胞判断的位置。这样我们能够有效获得真实的并且在基因数量上可以分析的数据。为了能深入分析和理解细胞状态和命运决定的机制, 将单细胞各组学技术结合在一起的单细胞多组学技术产生。

2016年发表的DR-seq和G&T-seq技术,实现在单细胞内同时进行基因组和转录组的测序分析,使得研究人员能够在分析细胞间基因组差异和基因表达异质性的同时,进一步理解基因组序列差异、拷贝数变异与转录组异质性之间的关系.随后在同一个单细胞内,基于转录组、染色质可及性、染色质构象、DNA拷贝数、DNA甲基化、蛋白质丰度或者空间状态等整合分析的多组学方法也相继出现。相较于利用不同的单细胞单组学测序方法从一类细胞中分别获取转录组、基因组、表观遗传组等进行分析,单细胞多组学测序技术可以从同一个单细胞中同时获取多种组学数据,可以更好地反映细胞在特定状态下各组学间的关联以及复杂的分子调控网络。单细胞多组学测序技术提供了全新的视角来分析细胞的分化路径、细胞间的交互调控和细胞亚群的分离现象。广州烈冰科技单细胞多组学商业化服务

单一的转录本研究不能体现生命进程的变化，因此多组学联合分析成为解析生命进程的有力工具。西安烈冰生物单细胞多组学服务机构

单细胞多组学技术优势：1. 构建蛋白质数据库，大幅度提高蛋白质鉴定数量；2. 不同层面表达水平分析，构建表达“全景图”；3. 多组学交叉验证：深层次挖掘其中调控机制；4. 对基因突变信息在蛋白水平上进行验证；5.精细医疗：实现genomics到protegenomics的转变。生物领域各个研究方面，1. 农林领域：抗逆胁迫机制，生长发育机制，育种保护研究等；2. 畜牧业：肉类及乳品质研究，致病机理研究等；3. 基础医学、临床诊断：生物标志物，疾病机理机制，疾病分型等；4. 生物医药：药物作用机理，药效评价，药物开发等；5. 微生物领域：致病机理，耐药机制，病原体-宿主相互作用研究等；6. 海洋水产：渔业资源，海水养殖，渔业环境与水产品安全等；7. 生物能源、环境科学领域：发酵过程优化，生物燃料生产，环境危定风险评估研究等；8.食品营养：食品储藏及加工条件优化，食品组分及品质鉴定，功能性食品开发，食品安全监检测等。西安烈冰生物单细胞多组学服务机构

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