烈冰生信团队倾情研发的NovelBrain®生信大数据分析平台,针对庞大的单细胞测序数据,能够实现细胞类型鉴定的快、精、准:一键导入genelist构建个性化基因列表;轻松一点即可展示Marker基因的Featureplot;任意修改Cluster的颜色和名称助力高效鉴定细胞类型;一键获得t-SNE图、Heatmap和Violin图:轻松获得并下载基因表达的t-SNE图、Heatmap、Violin图,还可以通过调节宽、高和系数比例来调节美观。平台上线300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板,帮助烈冰生信分析团队和自主分析用户实现分析工具和模板的快速调用和一站式全流程自动化分析,节省工作时间并提升整体工作效率。单细胞测序技术提供了单个细胞水平下的科学研究视角。上海BD单细胞实验服务
针对单细胞测序的细胞数量判断环节:主要是对细胞数量、基因表达量、测序质量进行整体描述。过滤标准:由于细胞破碎后游离RNA会释放到环境或孔中,并且测序中也会存在一些死细胞,导致数据存在background值。因此,我们需要设定一定的标准来过滤掉假细胞或死细胞。以10×Genomics为例,细胞数量判断主要通过分析UMICounts-Barcode曲线斜率拐点,当存在多个斜率拐点的时候,结合预期UMI=500时的细胞数量进行过滤。当斜率拐点低于UMI=500的时候,选择UMI=500作为细胞的判断的标准;否则,选择和预期细胞数量接近的拐点作为细胞判断的位置。这样我们能够有效获得真实的并且在基因数量上可以分析的数据。浙江BD单细胞测序烈冰生物成立于2010年,专注于单细胞测序领域科研服务。
烈冰生物在上海、北京、广州、西安、江西等多地部署单细胞测序实验组中心,多地部署搭建BDRhapsody单细胞实验平台,基于微孔的强大的高通量单细胞分析系统,为您提供可靠的单细胞分析工作流程,该系统可通过简单的唯恐把工作流程和多重条码标记系统,对高通量单细胞进行多组学的信息捕获,由此捕获的信息科进一步生成各种类型的二代测序(NGS)文库。之后对文库进行测序和基于NovelBrain生物大数据分析平台(云平台)的数据可视化分析,实现高位分辨率下的组织内基因的表达差异和表达丰度。
烈冰科技作为国内率先同时拥有10XGenomics和BDRhapsody双分选平台的测序服务商及云计算服务供应商,经过多年实战,拥有丰富的单细胞悬液制备和分选经验,实测BDRhapsody对能够高效捕获粒细胞。针对不同的分选平台、建库方法,实战总结搭建出不同的数据预处理工作流程;烈冰科技NovelBrain®生物大数据平台能有效支撑生命科学研究、医疗健康等领域对大数据分析的需求。高通量测序实验平台,包括NovaSeq6000、10XChromiumX、BDFACSMelody、PANNORAMIC数字切片扫描仪等,配合一支来自海内外名校、多学科交叉型的高素质综合团队,为您的科学研究保驾护航。十二年测序经验,累计服务与5000余项重要科研项目。
您的珍贵样本,可以放心依赖烈冰生物BDRhapsody单细胞捕获系统,基于BD平台从原理到效率到通量的多重包容性,使得BD平台对实验过程存在的批次效应产生的可能性更小,可在技术、生物学、实验中心和用户之间的样本检测获得一致、可靠的结果,而磁珠的拆分使用和即时存储,可增加实验设计的灵活性,配套的BDScanner可视化工作流程质控,从细胞铺板前微孔板空板检测,到细胞上样、磁珠上样、磁珠洗涤扫描、细胞裂解、磁珠回收、回收磁珠扫描等全过程,均实现BDScanner的可视化质控,让您的每个样本在实验端全程无忧。附加流式分选细胞表面Marker,对于较低分辨率的标志物也能有效鉴定,助力高要求测序项目。浙江BD单细胞测序
单细胞多组学测序可识别重要的转录因子,进行谱系和发育追踪。上海BD单细胞实验服务
SingleCellSequencing技术,即利用优化后的高通量测序技术(NGS,NextGenerationSequencing)分析每一个单个细胞的序列信息,从而更高分辨率地揭示细胞间的细胞差异以及其在微环境中的功能情况。那么问题来了,如何获得单个细胞?如果无法获得单个细胞这一切都是不成立的;如何获得大批量的单个细胞?单个组织细胞群体通常在百万级别以上,如果被检测的测序细胞数量过小精确度不足;如何低成本地获得大批量单个细胞?单细胞测序成本非常高,尤其是需要测2000~3000个以上的细胞的时候,如果单个细胞的分选成本也很高,技术根本无法普及。所以,正因为这些问题的存在使得高通量测序在单个细胞测序应用中的普及度一直不足,直到几个单细胞测序突破性技术的诞生。上海BD单细胞实验服务
上海烈冰生物医药科技有限公司是一家有着雄厚实力背景、信誉可靠、励精图治、展望未来、有梦想有目标,有组织有体系的公司,坚持于带领员工在未来的道路上大放光明,携手共画蓝图,在上海市等地区的医药健康行业中积累了大批忠诚的客户粉丝源,也收获了良好的用户口碑,为公司的发展奠定的良好的行业基础,也希望未来公司能成为行业的翘楚,努力为行业领域的发展奉献出自己的一份力量,我们相信精益求精的工作态度和不断的完善创新理念以及自强不息,斗志昂扬的的企业精神将引领上海烈冰生物医药科技供应和您一起携手步入辉煌,共创佳绩,一直以来,公司贯彻执行科学管理、创新发展、诚实守信的方针,员工精诚努力,协同奋取,以品质、服务来赢得市场,我们一直在路上!