重组的化脓性链球菌Cas9蛋白(SpCas9)是一种用于基因组编辑的核酸酶。它是CRISPR-Cas系统的一部分,该系统是一种细菌和古菌的适应性免疫防御机制,能够识别并切割入侵的外源核酸。Cas9蛋白在CRISPR系统中起到关键作用,它能够识别特定的原间隔子相邻基序(PAM),在引导RNA(gRNA)的引导下与目标DNA结合并进行切割。SpCas9蛋白由1053个氨基酸组成,相对较小的体积使其便于在体内递送,因此它在多种生物中都能进行有效的基因组编辑。为了提高SpCas9的表达量和溶解度,研究人员采用了多种策略,例如使用GB1促溶标签和多重启动子策略,这些策略可以显著提高蛋白的产量和活性,同时保持其功能活性不受影响。在基因编辑过程中,SpCas9与gRNA形成稳定的核糖核的蛋白(RNP)复合物,通过gRNA与基因组DNA的序列匹配来识别目标位点,并在距离NGGPAM序列3个碱基以内的位置切割DNA。为了增强SpCas9的基因组编辑效率,研究人员还开发了嵌合融合蛋白,例如与5’至3’核酸外切酶重组J(RecJ)或GFP融合的SpyCas9蛋白,这些嵌合蛋白可以显著提高靶向基因编辑效率,同时保持较低的脱靶效应。
磁珠法PCR/DNA纯化试剂盒与传统纯化方法相比具有以下优势:1.**操作简便快捷**:磁珠法纯化过程通常可以在15分钟内完成,包括结合、洗涤和洗脱步骤,无需复杂的离心或抽滤操作。2.**高纯度和高回收率**:磁珠法纯化得到的DNA纯度高,通常回收率可以达到90%以上,适用于100bp以上的DNA片段的纯化,对达到10kb片段DNA的纯化也能保持较好的效果。3.**适用性广**:磁珠法PCR/DNA纯化试剂盒适用于多种样本类型,包括PCR产物、酶切产物、连接产物等,也适用于低浓度样品的浓缩。4.**安全性高**:操作过程中不涉及酚/氯仿等有毒试剂,更加环保和安全。5.**灵活性**:可以根据实际状况灵活调节磁珠用量,适应不同体积和浓度的样品处理。6.**自动化和高通量**:磁珠法纯化试剂盒适合手工操作,也可用于自动化工作站或核酸自动提取仪,实现高通量操作。7.**温和的条件**:磁珠法条件温和,对DNA的损伤小,适合后续的多种分子生物学实验,如酶切、连接、转化细菌、测序、PCR、杂交等。8.DNA片段适应性**:适用于从150bp到50kb的DNA片段的纯化,能够满足大多数分子生物学实验的需求。
CUT&RUN和ChIC是两种用于研究蛋白质-DNA相互作用的技术,它们有一些关键的区别:1.**技术原理**:-**ChIC(ChromatinImmunocleavage)**:ChIC技术利用抗体将感兴趣的蛋白与ProteinA-MNase相结合来进行DNA切割。ChIC的优势在于使用TF特异性抗体系住MNase,并只在结合位点裂解。-**CUT&RUN(CleavageUnderTargetsandReleaseUsingNuclease)**:CUT&RUN技术则是在核的轻微MNase处理后释放单核小体和TF-DNA复合物,留下寡核小体。CUT&RUN通过在冰上进行简短的消化反应,在TF结合的MNase扩散到周边的基因组和裂解可接近的染色质之前在上清中恢复TF-DNA复合物。2.**操作步骤和简便性**:-**ChIC**:ChIC可能需要甲醛固定操作,这可能重新引入了ChIP-seq的一些问题,如交联导致的DNA和蛋白质的化学修饰。-**CUT&RUN**:CUT&RUN简化了操作步骤,使用磁珠固定细胞核,适用于新鲜和冷冻组织样本,缩短了生成DNA测序文库的时间(1-2天)。3.**背景信号和信噪比**:-**ChIC**:ChIC产生的背景信号可能较高,因为它可能涉及到非特异性的DNA切割。
在PCR实验中,确保引物与目标序列的完全特异性是至关重要的,这可以通过以下几个步骤实现:1.**基于已知序列设计引物**:根据目标DNA序列,使用计算机软件(如Primer3、Snapgene等)设计出两个互补的引物,以保证引物的特异性和准确性。2.**引物长度和Tm值**:通常选择引物长度为18-25个核苷酸,引物的Tm值(熔解温度)通常选择在50-60℃之间,以保证引物和目标DNA序列的稳定性。3.**避免与其他DNA序列的交叉反应**:使用BLAST等计算机软件进行引物特异性检查,确保引物只与目标序列互补,而不与其他非目标序列发生杂交。4.**避免引物自身结合**:设计引物时要避免引物之间自身结合,因为这会影响PCR反应的特异性和效率。5.**引物的3'端设计**:引物的3'端应避免富含GC,以确保与模板序列的稳定结合。同时,避免3'端存在序列,以防止形成引物二聚体。6.**避免内部二级结构**:设计引物时,应避免存在可能产生内部二级结构的序列,以保证引物与模板序列的结合。7.**使用在线工具进行引物特异性检验**:利用Primer-BLAST等在线工具设计引物,并进行特异性验证,确保引物只扩增特定目标序列。E1通常被认为是泛素化过程中的限速步骤,因为它涉及到泛素的激起和ATP的水解。
BstDNAPolymerase,LargeFragment(嗜热脂肪芽孢杆菌DNA聚合酶大片段)是一种常用于分子生物学实验的酶,特别是在等温DNA扩增技术中。以下是一些关于BstDNAPolymerase,LargeFragment的关键信息:1.**来源**:这种酶来源于嗜热脂肪芽孢杆菌(Bacillusstearothermophilus),是一种热稳定的DNA聚合酶。2.**活性**:BstDNAPolymerase,LargeFragment具有5'到3'的DNA聚合酶活性,并且具有链置换活性,这使得它能够用于等温扩增反应,如环介导等温扩增(LAMP)。3.**热稳定性**:由于其嗜热特性,BstDNAPolymerase,LargeFragment能够在较高的温度下保持活性,通常在60-65°C。4.**应用**:-**等温扩增**:用于LAMP和其他等温扩增技术,这些技术不需要传统的热循环仪。-**全基因组扩增**:用于快速扩增少量DNA样本,以进行进一步的分析。-**突变检测**:在某些情况下,用于检测特定基因的突变。5.**优点**:-**高保真度**:与某些其他DNA聚合酶相比,BstDNAPolymerase,LargeFragment具有较高的保真度。-**快速扩增**:等温扩增技术可以在短时间内快速产生大量DNA。UBE2L3作为泛素化途径中的关键酶,其在蛋白质降解、信号传导、细胞周期控制等重要内容有着作用。Recombinant Cynomolgus EPHA2 Protein,hFc Tag
泛素连接酶E3识别特定的靶蛋白,并促进E2上的泛素转移到靶蛋白的赖氨酸残基上,形成靶蛋白-泛素复合物。Recombinant Cynomolgus Coagulation factor XI Protein,His Tag
不同的DNA聚合酶在PCR中的应用差异主要体现在以下几个方面:1.**TaqDNAPolymerase**:是常用的DNA聚合酶之一,来源于Thermusaquaticus,具有较高的热稳定性及扩增效率。但它缺乏3'-5'核酸外切酶活性,即没有校正功能,因此其保真性相对较低。Taq酶适合扩增较短的DNA片段(通常不超过3kb),且在PCR产物的3'端带A碱基,可直接用于TA克隆。2.**PfuDNAPolymerase**:来源于Pyrococcusfuriosus,是一种高保真聚合酶,具有3'-5'外切酶活性,可以修复并纠正PCR反应中的腺嘌呤碱基误配,有效防止误差累积。Pfu聚合酶适用于需要高度准确的PCR扩增和DNA测序。3.**VentDNAPolymerase**:来源于Thermuslitoralis,具有中等保真度,比Taq聚合酶高两倍。它适用于GC含量高或复杂序列的PCR扩增,具有较高的热稳定性,半衰期可达6.7小时。4.**KODDNAPolymerase**:来源于Thermococcuskodakaraensis,具有高保真性和高热稳定性,保真性是Taq的约50倍,同时具有合成速度快的特点,聚合速度约为普通PfuDNAPolymerase的5倍,特别适合于高保真地扩增6kb以内的PCR产物。Recombinant Cynomolgus Coagulation factor XI Protein,His Tag
在分子生物学研究中,核酸染料是检测DNA和RNA的重要工具。然而,传统的溴化乙锭(EB)染料因其剧毒性和致病,逐渐被更安全的替代品所取代。GoldenView 吖啶橙核酸染料作为一种新型的核酸染料,凭借其性能和安全性,成为科研工作者的理想选择。GoldenView 吖啶橙核酸染料的成分是吖啶橙,这是一种细胞渗透性荧光染料,能够与核酸结合并发出荧光信号。其独特的荧光特性使其在检测双链DNA(dsDNA)时呈现绿色荧光(530 nm),而在与单链DNA(ssDNA)或RNA结合时则发出红色荧光(640 nm)。这种双重荧光特性不仅提高了检测的灵敏度,还为研究人员提供了更丰富的信息。在琼脂糖凝胶电泳...