高通量筛选的实验方法必须具备条件稳定，样本之间差异性小，容易检测，且可以大批量同时检测等特性。除了以上介绍的三种较为常用的方法之外，第二信使检测、细胞活力检测等方法也是常用的细胞水平的检测手段。化合物库的使用在筛选前期也起着十分重要的作用。在化合物未知的情况下，数量足够大的化合物库可增加识别目标的概率；不同细分用途的化合物库，则能进一步整合具有某项作用的尽可能多的化合物。MCE对不同方向、不同种类、性质不同的化合物做了详细分类，如生物活性化合物库、FDA上市库、天然产物库等可以供不同需求的科学家选择。随着技术的发展，MCE化合物库数量会越来越多，分类也越来越精细，这将节约前期筛选合适化合物所需的时间。此外，MCE还可以根据你的不同需求提供定制库~虚拟高通量筛选实验。湖南高通量筛选 cro
化合物库的质量包括三个方面：多样性、有效浓度、化合物库大小。化合物库的多样性制约着苗头化合物的新颖性，而化合物的有效浓度则影响着活性化合物的检出概率。因此化合物库的多样性越大，化合物的有效浓度越高意味着苗头化合物检出率更有保证。但是两者之前需要有一个平衡，一个化合物库里单一化合物簇（Cluster）维持在4~12个化合物的时候，多样性和有效浓度都能得到保障。另外，对于化合物库大小而言，理论情况下（基于多样性、有效浓度以及靶点的成药难度基本一致的随机筛选而言），大的化合物库有利于发现更多的苗头化合物。但是基于此次有限的汇总数据来看（有4个化合物库达到了百万级（0.6M~1.8M）），定向化合物库（FocusLibrary）（图七中红色圈部分）由于其自身的特点检出率较好，而大的化合物库并没有带来更高的苗头化合物检出率以及更高质量的苗头化合物青海流式细胞高通量筛选酶的高通量筛选实验。
然而传统的针对单一靶点的研究方法已经难以适应一些多基因疾病和病毒等相关药物的研究。而基于细胞水平的高内涵筛选(high content screening, HCS)技术实现了对化合物多靶点多参数的同时检测，从疾病相关基因调控通路和网络水平上研究药物的作用机制、代谢途径和潜在毒性等，也使在细胞水平评价活性化合物的成成为可能。从筛选载体上看，HCS和HTS并没有的区别，它的检测体积并未因检测指标增加而增高，操作步骤同样简单可行、可自动化。故HCS在新药研发中发挥越来越重要的作用。
高通量筛选技术，是目前药物筛选领域研究的重要课题，近年来，对它的研究应用虽然已取得了长足的发展，但仍然存在许多难题，如体外模型的筛选结果与整体药理作用的关系；对高通量筛选模型的评价标准以及新的药物作用靶点的研究和发现等。随着医药学的进步，高通量筛选技术在创新药物的研发中，一定会开拓出更广阔的空间。多学科理论和技术的结合 在高通量筛选过程中，不仅应用了普通的药理学技术和理论，而且与药物化学、分子生物学、细胞生物学、数学、微生物学、计算机科学等多学科紧密结合。这种多学科的有机结合，在药物筛选领域产生大量新的课题和发展机会，促进了药物筛选理论和技术的发展。组合化学高通量筛选。
高通量药物筛选的一个基本假设是：只要尝试了足够多的化合物，总能找到一个具有某种生化活性的化合物。筛选的化合物越多，获得具有良好生化活性的先导化合物的机率就越大。因此，一个庞大的化合物库也是高通量筛选不可或缺的部分。药物研发与开发是一个复杂与漫长的过程，特别是小分子药物的研发，其难点和关键在于如何快速高效的找到先导化合物（LeadCompound）。采用高通量药物筛选（High-throughputscreening，HTS）来发现新的先导化合物仍然是小分子药物研发的优先。高通量筛选的主要目的是什么。青海流式细胞高通量筛选
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高通量筛选的特色效用高通量筛选技术是将多种技术方法有机结合而形成的一种新技术体系，它以微板形式作为实验工具载体，以自动化操作系统执行实验过程，以灵敏快速的检测仪器采集实验数据，以计算机对数以千计的样品数据进行分析处理，从而得出科学准确的实验结果和特色效用。英国学者AlanD研究提示，一个实验室采用传统的方法，借助20余种药物作用靶位，1年内能筛选75000个样品；1997年高通量筛选技术发展初期，采用100余种靶位，每年可筛选100万个样品；1999年高通量筛选技术进一步完善后，每天的筛选量就高达10万种化合物。近年来,光学测定技术在美、英两国研究人员在高通量筛选检测中，努力进行了光学测定方法的研究，建立了大量的非同位素标记测定法，如用分光光度检测法筛选蛋白酪氨酸激酶抑制剂、组织纤溶酶原剂等，均获得成功。湖南高通量筛选 cro
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