显微镜以显微原理进行分类可分为偏光显微镜、光学显微镜与电子显微镜和数码显微镜。偏光显微镜：载物台下装有起偏器，物镜与目镜之间装有检偏器，用于检测物质的各向同性和各向异性的双折射性质的显微镜。光学显微镜：一类利用光学原理将微小物像进行高倍放大以便肉眼观察的仪器。电子显微镜：以高能电子为光源，以静电透镜或电磁透镜成像，具有纳米至亚埃级分辨力，放大率可达数百万倍的显微镜。可用于观测和分析各类物体的超微结构。依原理和功能又分为透射电子显微镜、扫描电子显微镜、发射电子显微镜等多种类型。数码显微镜：一种将精锐的光学显微镜技术、先进的光电转换技术、液晶屏幕技术完美地结合在一起而开发研制成功的一项高科技产品。从而，我们可以对微观领域的研究从传统的普通的双眼观察到通过显示器上再现，从而提高了工作效率。光学显微镜使用可见光进行照明。二手蔡司显微镜费用
电子显微镜用短波电子取代光子来观察样品，能突破衍射极限从而突破光学显微镜200nm分辨率极限的限制，能看到病毒等超微目标的清晰型态和结构，但缺点是，光学显微镜能看活的目标，电子显微镜下的目标都是死的，而且电子显微镜的制样操作等步骤都非常麻烦，便利度不高。透射的电子显微镜和简单的生物显微镜类似，只是透射光变成透射电子束，成像是平面的，目前已经很少使用。更多的是使用扫描电子显微镜，典型扫描电子显微镜是非常大块头的东西，但也有比较小型化的桌面机，比如台式扫描电子显微镜ZEM15，类似共聚焦显微镜，能3D重构目标型态，观察的效果更好，但也很高成本。广东OLYMPUS STM7工业测量显微镜哪个品牌好数码显微镜的优势在于仪器的人机工程学设计。
原子力显微镜使用超微针尖靠近样品表面，样品表面与针尖的原子间相互作用力使得针尖所在的悬臂发生微小形变，被放大测量后转化成样品表面形貌的信息。横向分辨率能够达到纳米量级，其分辨率极大依赖于探针工艺的精细程度，若以比较先进的碳纳米管做探针，横向分辨率则能突破埃量级。原子力显微镜除了用于样品表面形貌成像外，还是显微操作的重要工具，对针尖表面进行修饰后可以于待测量的分子特异性相互作用，并进行拉伸，挤压等操作，对其力学性质进行测量。
生物显微镜的镜片都是用精密加工过的光学玻璃片制成的,为了增加透光率,都需在光学玻璃片的两面涂上一层很薄的透光膜。这样透光率就可以达到97%—98%。这一层透光膜表面很平整光滑,且很薄,一旦透光膜表面被擦伤留有痕迹,它的透光率就会受到很大影响。观察时会变得模糊不清。所以在擦拭镜片时,一定要用干净柔软的绸布或干净毛笔轻轻擦拭,若用擦镜纸擦拭则更要轻轻擦拭,以免损伤透光膜。若是目镜、物镜镜头内部的镜片被污染或霉变,就必须拆开清洗。目镜可直接拧开拆下后进行清洗。但物镜的结构较复杂,镜片的叠放,各镜片间的距离都有非常严格的要求,精度也很高。生产厂家在装配时是经过精确校正而定位的。所以拆开清洗干净后,必须严格按原样装配好。显微镜这类产品是一种尤其精密的仪器，一定要小心轻放。
冷冻电镜已有几十年的历史了，它的原理是向快速冷冻的样品发射电子并记录生成的图像从而确定其形状。探测回弹电子的技术以及图像分析软件的进步触发了一场始于2013年的“分辨率改变”，并让研究人员较终得到了较清晰的蛋白质结构——几乎与利用X射线晶体技术得到的结果一样好。X射线晶体技术的出现时间更早，主要根据蛋白质晶体被X射线轰击时形成的衍射图案推断蛋白质的结构。后续的软硬件更新使得冷冻电镜的结构分辨率得到了更大的提升。但是科学家还是要依赖X射线晶体学才能获得原子分辨率的结构。问题是，研究人员可能要花几个月到几年的时间才能使蛋白质结晶，而且许多医学上重要的蛋白质不会形成可用的晶体；相比之下，冷冻电镜只需要把蛋白质置于纯化溶液中即可。电子显微镜的分辨率相对于光学显微镜有效提高。广东MF-A2017D工具显微镜哪家好
金相显微镜经常被用来观察金属和矿物等不透明物体金相组织。二手蔡司显微镜费用
当一束平行于光轴的光线通过凸透镜后相交于一点，这个点称“焦点”，通过交点并垂直光轴的平面，称“焦平面”。焦点有两个，在物方空间的焦点，称“物方焦点”，该处的焦平面，称“物方焦平面”；反之，在像方空间的焦点，称“像方焦点”，该处的焦平面，称“像方焦平面”。光线通过凹透镜后，成正立虚像，而凸透镜则成正立实像。实像可在屏幕上显现出来，而虚像不能。球差是显微镜轴上点的单色相差，是由于透镜的球形表面造成的。球差造成的结果是，一个点成像后，不在是个亮点，而是一个中间亮边缘逐渐模糊的亮斑，从而影响成像质量。球差的矫正常利用透镜组合来消除，由于凸、凹透镜的球差是相反的，可选配不同材料的凸凹透镜胶合起来给予消除。旧型号显微镜，物镜的球差没有完全矫正，应与相应的补偿目镜配合，才能达到纠正效果。一般新型显微镜的球差完全由物镜消除。二手蔡司显微镜费用
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