在我们食品微生物检测过程中，除了我们知道要检测的目标微生物之外，往往会出现一些和目标微生物表现不一，但你又想知道它是什么菌属的情况，特别是对于一些生产企业，有时候往往会怀疑是否是因为这个“非目标菌”的存在，从而影响到了产品质量。那怎么去鉴定那些“非目标”微生物呢？又有哪些方法和手段可以采用呢？传统的细菌系统分类，也就是常说的鉴定，通常是通过纯培养分离后从形态学、生理生化反应特征以及免疫学特性（血清学分析）进行鉴定。这也是我们目前国标中常用的鉴定手段，这种方法的优点就是所用试剂简单易得，常规实验室即可展开，经济实用，缺点呢，就是鉴定所需时间较长，且容易判断不准确。用这种方法，要先进行革兰氏染色，从镜检分析其可能的微生物种属，再根据判断结果，按照《伯杰氏手册》上的生化项目进行实验，确定其可能的微生物种属。比如，镜检是革兰氏阳性杆菌，且周围或菌体顶端有芽孢产生，这时候我们就要往芽孢杆菌的方向去进行生理生化鉴定。传统的微生物检测方法：直接显微镜观察。河北未知病原微生物鉴定方法
对于无菌药品生产来说，生产区域的微生物种类非常有限，更具无菌药品的具体生产内容和过程，洁净区内会有芽孢杆菌占绝大多数酵母菌、霉菌和葡萄球菌少量存在，放射根瘤菌、苛养颗粒链菌等少数微生物种类。在无菌药品生产过程中，应初步建立微生物数据库，建立洁净区微生物数据库是追溯洁净区微生物污染来源的有效方法，有效指导并控制无菌药品生产中的污染问题。同时，为防止微生物污染，通过微生物数据库并结合一些常规方管理法，比如对污染源及其途径进行了解，并进行微生物限度检查，控制药品质量。注意在洁净区的人员数量应控制好，并要求人员具有自我约束的意识等，从而有效控制洁净区微生物。在生产中应用微生物鉴定技术和检测设备向微型化以及多功能化方向发展，更具有较快的检测速度以及更为准的鉴定结果。河北未知病原微生物鉴定方法对于无菌药品生产来说生产区域的微生物种类非常有限。
未知病原微生物样本需要经历：核酸纯化-文库构建-生物信息学分析这三大基本流程才能完成鉴定。高通量测序技术之解决疑难鉴定问题并提高检测的灵敏度，在病原微生物检测与鉴定方面，对一些非典型症状的样品，依靠先验知识与传统检测方法无法有效对病原微生物进行检测时，高通量测序技术通过对基因组进行全序列测序，可有效检测出在某种材料中可能携带的之前未报道过的病原微生物,或鉴定出混合侵染样品中的不同病原分离物，降低有害生物传入的风险。相对传统的生物学、血清学与分子生物学检测技术，高通量测序技术具有更高的特异性和灵敏性，即使在样品中病原微生物存在量较低的情况下依然能够做出快速、准确的检测，尤其适用于病原微生物侵染初期的样品材料的检测。
微生物鉴定方法：1.从观察显微镜下甚至光镜下的微生物的的那个细胞的形态，比如说，是球菌，还是杆菌，还是弧菌，还是螺旋菌，这都是可以从微生物的单个细胞形态上区分的。还有就是细胞的形态，比如说是否有鞭毛、芽孢之类的东西，都是微生物鉴别的特征性特征。2.就是观察细菌的菌落形态，因为细菌生长繁殖到一定阶段大多都是以菌群的形态存在的，不同的细菌菌落在不同的培养基上的生长情况不同，部分细菌对培养基要求较高，部分培养基能在特定的培养基上生存，通过微生物对不同类型培养基的适应性，可以起到对菌种的有效区分。未知病原微生物鉴定注意事项：只有有效地检测微生物的含量，才能采取有效地措施。
微生物鉴定还可以用微生物对噬菌体的敏感性作为指标来鉴定微生物的种属。因为各种噬菌体都有其严格的宿主范围，不同的细菌作为噬菌体的宿主对应有特定的已知特性的噬菌体，其和噬菌体的作用方式也有接合，转化，转接，溶原性转换和原生质体融合等多种方式。部分细菌可以采用血清学反应的方法来进行区分和鉴别，就比如说常见的疑似伤寒沙门菌的菌种鉴别，我们可以利用血清学反应，现有的已知的对应的血清学反应抗体，蘸取菌种液在抗体液中涂抹，看是否会出现血凝现象（即是否出现淡白色的凝集颗粒）。大多微生物鉴定系统是采用细菌分解底物后反应液中pH变化的。杭州病原筛查方法
传统病原微生物检测方法：生化方法。河北未知病原微生物鉴定方法
微生物检测基础知识：微生物检测涉及多行业和领域，在实验室检测中有着重要的地位。将微生物接到适于它生长繁殖的人工培养基上或活的生物体内的过程叫做接种。划线接种这是常用的接种方法。即在固体培养基表面作来回直线形的移动，就可达到接种的作用。常用的接种工具有接种环，接种针等。在斜面接种和平板划线中就常用此法。三点接种是在研究霉菌形态时常用此法。此法即把少量的微生物接种在平板表面上，成等边三角形的三点，让它各自形成菌落后，来观察、研究它们的形态。除三点外，也有一点或多点进行接种的。河北未知病原微生物鉴定方法
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