河北医院菌群检测科研助力

GenomeMedicine近期发表的文章，通过对RA病人的粪便菌群进行宏基因组测序分析，发现RA患者中存在与疾病活动指数——MCII相关的肠道菌群的分类和功能特征，且利用肠道菌群特征进行AI训练预测哪些患者MCII状态会发生改变，效果明显。提示我们改变肠道菌群以提高临床疗效可能是RA未来改善的希望。①对1988年-2014年间诊断为RA的患者进行回顾性、观察性队列研究，收集64份粪便样本进行宏基因组测序；②年龄是导致肠道菌群组成差异的比较大决定因素，其次是疾病活动指数——MCII状态，且MCII+和MCII-患者的基线肠道菌群特征、功能性生化途径都存在明显差异；③基线检查和随访中，取得临床改善的患者肠道菌群的α多样性较高；④神经网络利用肠道菌群预测哪些患者MCII状态会发生改变，被证明是非常有效的，证明了肠道菌群的潜在临床实用性。肠道菌群检测的取样要求。河北医院菌群检测科研助力

肠道菌群失调与自身免疫疾病的发展相关。Nature Communications上发表的一项新研究，发现类风湿关节炎（RA）的发生与肠道屏障功能的受损密切相关，新发病RA患者的血清连蛋白表达增加，而肠道紧密连接蛋白表达降低。在关节炎小鼠模型中，肠道炎症发生早于关节炎的发病，而靶向肠道屏障或连蛋白可起到缓解关节炎的作用。该研究提示，靶向肠道屏障或是改善类风湿关节炎等自身免疫疾病的潜在策略。①对比40名RA患者、41名健康对照、19名cancer患者及21名丙肝患者，发现RA患者的血清连蛋白水平明显升高；②纵向研究结果显示，血清连蛋白水平较高者在1年内发生RA的风险更高；③RA患者（包括新发病患者）肠道上皮细胞中的紧密连接蛋白（包括occludin与claudin-1）表达明显降低；④在胶原诱导的关节炎（CIA）小鼠模型中，肠道炎症及T细胞在肠道中的累积发生于关节炎发病之前；⑤丁酸盐处理降低肠道通透性，或使用药物靶向抑制连蛋白可缓解CIA。安徽自闭症患者菌群检测临床应用肠道菌群检测--高通量测序平台的应用。

虽然目前各大医院拥有口腔、肠道、呼吸道、泌尿生殖道等多个部位的微生物检测项目，但几乎都是采用细菌培养观察等传统方式进行检测，无法全部了解微生态菌群健康状况。以肠道菌群检测为例，通过16SrDNA基因序列分析法、荧光定量qPCR等的核酸检测技术，可以了解人体肠道菌群微生态和特定菌的情况。全新的诊疗研究方向，也带来了更为宏大的商业想象力。根据美国市场研究机构TransparencyMarketResearch的调研分析，目前人体微生物市场主要分为诊断和诊疗两个方向，预测2020年到2024年的复合年均增长率将达9.2%。据广证恒生预测，微生物诊疗领域的全球市场空间在2026年有望达到100亿美元。

可分泌IL-10的调节性B细胞（Breg）对肠道菌群信号的应答在维持免疫耐受中发挥重要作用。CellMetabolism上发表的一项研究，在类风湿关节炎患者及关节炎小鼠模型中均观察到粪便丁酸盐水平的降低，而补充丁酸盐可缓解小鼠的关节炎。机制上，丁酸盐可通过促进菌群代谢产物——5-羟基吲哚-3-乙酸的产生，到达Breg上的芳香烃受体，以增强Breg的免疫抑制功能。①类风湿关节炎患者的粪便丁酸盐水平降低，与CD19+CD24hiCD38hiB细胞及IL-10+Breg的减少相关；②关节炎小鼠模型的粪便丁酸盐及乙酸盐水平降低，补充丁酸盐可以Breg依赖性方式缓解关节炎；③补充丁酸盐可增强Breg的免疫抑制功能，并抑制生发中心B细胞及浆母细胞的分化；④机制上，补充丁酸盐促进了菌群将5羟色胺代谢为5-羟基吲哚-3-乙酸，从而到达芳香烃受体，以活化Breg中的芳香烃受体依赖性基因转录。如何评价肠道菌群检测的差异性？

肠道菌群对人体整体健康产生深远影响：细菌通常被视为对健康有害的东西，但我们人体充满了细菌！并非所有细菌都是有害的，比如在我们的肠道菌群中存在数万亿的细菌，可根据其中存在的细菌状况对身体健康产生深远影响。研究显示，许多人类疾病都可能与肠道微生态失衡有关。肠道微生物在人类代谢食物、抵御侵袭和应答药物等过程中起着非常重要的作用。不过人类的生活方式、卫生习惯、饮食药物等都会影响肠道微生物的种类、数量和功能，进而影响到整个机体的健康程度。肠道菌群检测：对抗腹泻新武器；山东粪便菌群检测科研助力

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约50%的类风湿关节炎（RA）患者对甲氨蝶呤改善不产生充分的应答，但缺乏可预测患者应答的预后标志物。Arthritis and Rheumatology上发表的一项研究，对比分析了对甲氨蝶呤改善应答及不应答的RA患者在改善前的肠道菌群差异，发现基于菌群建立的模型可较准确地预测患者对甲氨蝶呤改善的应答。另外，体外共培养肠道菌群与甲氨蝶呤的结果表明，肠道菌群对甲氨蝶呤的代谢或消失可能抑制甲氨蝶呤的改善效果。①纳入26名新发RA患者，16名对甲氨蝶呤改善不应答；②应答患者与不应答患者的粪便菌群多样性、组成及功能存在差异；③不应答患者的菌群多样性更高，厚壁菌门/拟杆菌门比值增加，广古菌门丰度升高，MAPK信号、DNA复制、脂肪酸降解、嘌呤代谢等相关通路明显富集；④在另外21名新发RA患者中，基于菌群的模型可较准确地预测对甲氨蝶呤改善的应答（AUC=0.84）；⑤体外共培养患者的粪便菌群与甲氨蝶呤，培养后的甲氨蝶呤水平与患者应答明显相关。河北医院菌群检测科研助力