上海消化道疾病菌群检测临床应用

2015年9月24日，万众瞩目的“引文桂冠奖”由汤森路透出版集团正式发布。这个奖项之所以如此出名，是因为获此殊荣的科学家，有很大机会摘得诺贝尔奖的王冠。今年的“引文桂冠奖”授予了18位科学家，他们都是诺贝尔奖的有力竞争者，其中医学组高居早期的是美国圣路易斯华盛顿大学的JeffreyI.Gordon教授。他和他的团队，通过对肠道菌群的长期和细致研究，揭示了人与肠道微生物间的复杂关系，发现肠道菌群失调与营养不良、肥胖症、糖尿病等疾病息息相关。Gordon教授的研究成果，为我们理解肠道菌群与人体健康之间的微妙关系，提供了全新的视野。肠道菌群检测有重大意义。上海消化道疾病菌群检测临床应用

GenomeMedicine近期发表的文章，通过对RA病人的粪便菌群进行宏基因组测序分析，发现RA患者中存在与疾病活动指数——MCII相关的肠道菌群的分类和功能特征，且利用肠道菌群特征进行AI训练预测哪些患者MCII状态会发生改变，效果明显。提示我们改变肠道菌群以提高临床疗效可能是RA未来的希望。①对1988年-2014年间诊断为RA的患者进行回顾性、观察性队列研究，收集64份粪便样本进行宏基因组测序；②年龄是导致肠道菌群组成差异的比较大决定因素，其次是疾病活动指数——MCII状态，且MCII+和MCII-患者的基线肠道菌群特征、功能性生化途径都存在明显差异；③基线检查和随访中，取得临床改善的患者肠道菌群的α多样性较高；④神经网络利用肠道菌群预测哪些患者MCII状态会发生改变，被证明是非常有效的，证明了肠道菌群的潜在临床实用性。广东消化道疾病菌群检测临床应用肠道菌群检测--解读人类“第二基因组”。

肠道微生物组主要有四大类组成厚壁菌门、拟杆菌门、放线菌门和变形菌门。人体肠道微生态物中大多数为拟杆菌和厚壁菌，厚壁菌/拟杆菌也被视为衡量肠道微生物健康的一项指标。但是，肠道微生物组成存在个体差异，而且对于宿主和环境参数的变化十分敏感。有趣的是，宿主中条件致病菌（如大肠杆菌、梭状芽孢杆菌、粪便拟杆菌和迟缓埃格特菌）的丰度增加以及细菌源（罗氏菌、柔嫩梭菌、的短链脂肪酸的丰度减少，都与心血管疾病的风险增加有关。因此，微生物的种类及其相对丰度都是影响心血管疾病发生的重要因素。

多中心临床试验支持菌群移植预防抵抗细菌菌药物的耐药细菌：①RBX2660是一款用于改善复发性艰难梭菌infection的菌群悬剂,其中排除了临床危害性大的antibiotic耐药细菌以及特定病毒、寄生虫；②包含29名参与者的多中心临床研究发现，服用RBX2660后，患者菌群结构与RBX2660的菌群结构越接近，预防CDI的效果越好；③使用RBX2660两个月后，患者肠道中耐药肠杆菌科细菌明显减少，耐药基因载量随着RBX2660菌群定植程度上升而下降；④菌群移植减少肠道菌群耐药基因组的方法，有助于防控耐药细菌infection和抵抗细菌药物耐药性传播。肠道菌群检测的取样要求。

16SrRNA基因测序以细菌16SrRNA基因测序为主,主要是研究样品中的物种分类、物种丰度系统进化、功能预测以及微生物与环境互作关系等。16SrRNA基因是编码原核生物核糖体小亚基的基因，长度约为1542bp，其分子大小适中，突变率小，是细菌系统分类学研究中常用和有用的标志。16SrRNA基因序列包括9个可变区和10个保守区，保守区序列反映了物种间的亲缘关系，而可变区序列则能体现物种间的差异。16SrDNA是细菌染色体上编码16SrRNA相对应的DNA序列，16srRNA是由16srDNA转录来的，一般扩增检测和分析的对象都是16srDNA。肠道菌群检测的专业团队就在你身边--上海沃本。云南亚健康人群菌群检测风险预测

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    某些肠道细菌被认为是AS疾病进展的新因素。研究发现，中国AS患者的类杆菌属（Bacteroides）和普雷沃氏菌属（Prevotella）相对减少，而链球菌属（Streptococcus）和大肠埃希菌属（Escherichia）富集。然而，在波兰东部，总胆固醇水平和低密度脂蛋白胆固醇值高的中年男性肠道中富含普雷沃氏菌属（Prevotella），但是梭菌属（Clostridium）和粪杆菌属（Faecalibacterium）含量较低。例如，一些AS患者的条件致病菌柯林斯氏菌属（Collinsella）增多。同时，有些微生物也可以降低AS斑块的形成。比如，在患者和小鼠模型中均发现，产丁酸盐的细菌罗斯伯里氏菌属（Roseburia）和真杆菌属（Eubacterium）的相对减少与AS病变的发展呈负相关关系。据推测，这些微生物可能会影响宿主的炎症水平。 上海消化道疾病菌群检测临床应用