以基（底）肥为主。有机肥施用方法一般以基（底）肥使用为主，在作物栽种前将肥料均匀撒施，耕翻入土。如采用条施或沟施，要注意防止肥料集中施用发生烧苗现象，要根据作物田间实际情况确定有机肥的亩施用量。2、与化肥配合使用。有机肥的长效性，不能代替化学肥料的，必须根据不同作物和土壤配合化肥，实用才能取得比较好效果。3、要充分腐熟。未经腐熟发酵的有机肥施入土壤后，不能被作物直接吸收利用，仍需继续发酵腐熟，并产生有害的气体0根系。4、制作有机肥时加添加剂事半功倍。在农家肥里人为的添加一些所谓的添加剂，就可以使农家肥的肥效加倍提高，并防止它的有效养分挥发流失。从目前进展来看，北京、上海、江苏、浙江等省市财政安排了专项资金支持农民利用有机肥。湖南生物有机肥
根据种植密度施肥密度大可全层施肥，施肥量大；密度小，应集中施肥，施肥量减小。果树按棵集中施肥。行距较大，但株距小的蔬菜或经济作物，可按沟施肥；行、株距均较大的作物，可按棵施肥。注意水肥配合肥料施入土后，养分的保存、移动、吸收和利用均离不开水，施肥应立即浇水，防止养分的损失，提高肥料的利用率。根据栽培设施保护地为密闭的生长环境，应使用充分腐熟的有机肥料，以防有机肥料在大棚内二次发酵，造成氨气富集而烧苗。由于保护地内没有雨水的淋失，土壤溶液中的养分在地表富集容易产生盐害，因此有机肥料、水溶肥一次使用量不要过多，并施肥后应配合浇水。辽宁有机肥工艺科学家发现,长期单施氮肥,不使农田生态环境、土壤的理化性状以及微生物群落受到不同程度的破坏。
秸秆还田已经是普遍推广的增加土壤有机质的农业措施，秸秆有机质含量很高，接近90%，但绝大部分有机质都是纤维素。秸秆还田一二年后，经过土壤微生物腐解，其实**终能留在土壤中的有机质不会超过15%，绝大部分以二氧化碳的形式散失到空气中了。我国规定，商品生物有机肥料的有机质含量要大于40%。为什么是40%？而不是60%、80%？科学研究表明，一般有机原料经过腐熟后，有机质含量应该在35％-45％之间，过小，说明原料纯度不够，其中掺入了沙子、粘土等过多杂质，过大，说明腐熟不彻底！
降温阶段当高温阶段持续一定时间后，纤维素、半纤维素、果胶物质大部分已被分解，剩下很难分解的复杂成分（如木质素）和新形成的腐殖质，微生物的活动减弱，温度逐渐下降。当温度下降到40℃以下时，中温性微生物又成为优势种类如果降温阶段来的早，表明堆制条件不够理想，植物性物质分解不充分。这时可以翻堆，将堆积材料拌匀，使之产生第二次发热、升温，以促进堆肥的腐熟。⑷腐熟保肥阶段堆肥腐熟后，体积缩小，堆温下降至稍高于气温，这时应将堆肥压紧，造成厌气状态，使有机质矿化作用减弱，以利于保肥。简而言之，有机堆肥的发酵过程实际上就是各种微生物新陈代谢、繁殖的过程。微生物的新陈代谢过程即有机物分解的过程。有机物分解必然会产生能量，这些能量推动了堆肥化进程，使温度升高，同时还可干燥湿基质。许多堆肥用的基质携带人类、动植物的病原体，以及令人讨厌的生物如杂草种子。在堆肥过程中，通过短时间的持续升温，可以有效地控制这些生物的生长。因此，高温堆肥的一个主要优势就是能够使人和动植物病原体以及种子失活。堆肥是在一定条件下通过微生物的作用，使有机物不断被降解和稳定，并产出一种适宜于土地利用的产品的过程。
畜禽粪便类有机肥料的有机质含量中等，氮、磷、钾等养分含量丰富，由于其来源***，使用量比较大。但由于其加工条件的不一样，其成品肥的有机质和氮、磷、钾养分差别，选购使用该类有机肥料时应注意其质量的判别。以纯畜禽粪便工厂化快速腐熟加工的有机肥料，其养分含量高，应少施，集中使用，一般做底肥使用，也可做追肥。含有大量杂质，采取自然堆腐加工的有机肥料，有机质和养分含量均较低，应做底肥使用，量可以加大。另外，畜禽粪便类有机肥料一定要经过灭菌处理，否则容易给作物和人、畜传染疾病。绿肥是经人工种植的一种肥地作物，有机质和养分含量均较丰富。但种植、翻压绿肥一定要注意茬口的安排，不要影响主要作物的生长。绿肥一般有固氮能力，应注意补充磷钾肥。垃圾类有机肥料的有机质和养分含量受原料的影响，很不稳定，每一批肥料的有机质和养分含量都不一样，一般含量不高，适宜做底肥使用。由于垃圾成分复杂，有时含有大量对人和作物极其有害的物质，如重金属、放射性物质等，使用垃圾肥时对加工肥料的垃圾来源要弄清楚，含有有害物质的垃圾肥严禁施用到蔬菜和粮食作物上，可用于人工绿地和绿化树木。我国过去30多年化肥尤其化学氮肥施用太多,出现了诸如土壤酸化、养分不平衡供应、土壤生物活性下降等问题。黑龙江有机肥生产线
有机肥养分齐全，肥效悠长，可改良泥土，培肥地力。湖南生物有机肥
有机肥需开沟施入，且要充分和土壤进行接触，不然没有改土作用，还易流失。有机肥的施用位置要靠近吸收根，即树冠**垂直投影处，并适度深施，引根下扎，太近大根不仅不利吸收，还易烧根。施用有机肥时应注意与无机肥、生物菌肥等的配合使用，以满足作物对营养的需求与土壤营养的补充。矿物源有机肥的原料的前体是动植物残体千百年矿化而成风化煤、褐煤，在改良土壤团粒结构、提高矿质营养元素利用率方面效用更佳。生物质有机肥的原料以畜禽粪便及秸秆腐熟为主，富含氨基酸、核酸、多肽、蛋白酶等活性成分，对树体的调理效用更明显。湖南生物有机肥
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